Departementet San Pedro (Departamento de San Pedro) är ett av Paraguays 17 departement. Departementet skapades 1906. Departementets huvudort är San Pedro de Ycuamandiyú.
San Pedro har en yta på cirka 20 002 km² med cirka 319 000 invånare. Befolkningstätheten är 16 invånare/km². Departementet ligger i Región Oriental (Östra regionen).
Huvudorten är San Pedro de Ycuamandiyú med cirka 8 000 invånare.
