El municipio de Santa Cruz Xoxocotlán es uno de los 570 municipios en que se encuentra dividido el estado mexicano de Oaxaca. Situado en el centro del estado, forma parte de la Zona metropolitana de Oaxaca. Su cabecera es la ciudad de Santa Cruz Xoxocotlán.
El municipio de Santa Cruz Xoxocotlán se localiza en la zona central en el estado de Oaxaca. La distancia que tiene a la capital del estado es de 5 kilómetros. Pertenece a la región valles Centrales y al distrito Centro. Se sitúa en las coordenadas geográficas extremas de 16° 57' - 17° 04' de latitud norte y 96° 42' - 96° 49' de longitud oeste. La extensión territorial total que constituye al municipio de Santa Cruz Xoxocotlán es de 44.006 kilómetros cuadrados. En cuanto a su altitud, ésta es variable debido a las diferentes elevaciones que hay en su territorio pero en datos generales oscila entre un máximo de 2 000 y un mínimo de 1 500 metros sobre el nivel del mar.
El municipio limita al norte con el municipio de San Pedro Ixtlahuaca y el municipio de Santa María Atzompa y al noreste con el municipio de Oaxaca de Juárez; al este limita con el municipio de San Antonio de la Cal, el municipio de San Agustín de las Juntas y el municipio de Ánimas Trujano, al sureste con el municipio de Santa María Coyotepec y al sur con el municipio de Villa de Zaachila. Finalmente, al suroeste limita con el municipio de San Raymundo Jalpan y con el municipio de Cuilápam de Guerrero.
